PA-Cre with Magnet Systemは、Creリコンビナーゼを二分割してDNA組換え活性を失わせた断片（split-Cre ; CreN59とCreC60）に光スイッチタンパク質Magnet System（nMagとpMag）を連結しています。PA-Creは、暗所ではloxP（塩基配列）に対するDNA組換え活性を示しません（Inactive P A-Cre）。青色光（470±20nm）を照射すると、PA-Creに導入したMagnet System（nMagとpMag）の結合により、Creリコンビナーゼの分割体（CreN59とCreC60）の相補化（complementation）が起こり、PA-Creは速やかに活性を回復します（Active PA-Cre）。この作用機構により、2つのloxPで挟まれたDNA配列の組換え反応を、青色光を照射したタイミングで、青色光を照射した細胞でのみ起こし、遺伝子の働きを、時間・空間特異的にコントロールすることが可能になります。
