『JKlustor』は、クラスタリングとダイバーシティ解析のコンポーネントです。
クラスタリングをはじめ、ダイバシティ計算、分子フィンガープリント、
共通部分構造、ディスクリプター等に基づくライブラリの比較を行うことが可能。
コンビナトリアルケミストリ、ドラッグデザインその他化合物ライブラリの
解析が必要な場面で利用できます。
【特長】
■クラスタリング、ディスクリプター等に基づく
ライブラリの比較を行うことが可能
■化合物ライブラリの解析が必要な場面で利用できる
■クラスタリングの手法や計算の最適化に関して
オプションを選択できる
※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
基本情報
【提供可能なコマンドラインツール】
■GenerateMD:ダイバシティー解析やクラスタリングに用いる、ケミカルハッシュフィンガープリント
およびファーマコフォアフィンガープリントを含む多様な分子ディスクリプターを生成
■Compr:ダイバシティ計算や非類似性計算に基づき、化合物ライブラリなど2つのオブジェクトを比較
■Jarp:variable-length Jarvis-Patrick clusteringを行う
■Ward:approach.RNNアプローチを適用し、Ward’s hierarchic clustering method による
分子のクラスタリングを行う
■LibMCS:階層的な最大共通部分構造に基づきクラスタリングを行い、ダイバシティー解析や
ocused set profilingに用いることができる
■CreateView:構造式と計算結果を含むSDファイルを生成
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型番・ブランド名 | ChemAxon JKlustor |
用途/実績例 | ※詳しくは関連リンクをご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。 |
お問い合わせ
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パトコア株式会社