ダッソー・システムズ株式会社

【データシート】BIOVIA Discovery Studio 2021 - 新機能・強化機能のご紹介

最終更新日: 2021-05-26 12:02:58.0

上記では、電子ブックの一部をご紹介しております。

カタログ発行日:2021/5/17
今回も引き続きバイオセラピューティクスやシミュレーション、低分子研究などの分野における重要な科学的進展が実装!
複雑な生体分子系をモデリングして把握するためには、分子シミュレーションが必要不可欠です。今回のリリースでは、MSLD (Multi-Site Lambda Dynamics) のワークフローがより使いやすくなり、より多くの GPU 対応プラットフォームを導入することで研究を加速させます。BIOVIA Pipeline Pilotをベースにして構築されたDiscovery Studioは、ライフサイエンスの創薬研究分野に最適な、さまざまな機能を網羅したコラボレーティブなモデリング & シミュレーション・アプリケーションです。


【新機能】
■MSLD1 の作業がより快適に
■CHARMm-DOMDEC による FEP 計算に対応
■原子タイプや力場のパラメータが追加
■GPU 対応プロトコルにより、計算を高速化

【強化機能】
■生物製剤の粘度や凝集の予測に関する機能が強化
■タンパク質モデリング機能を多方面から強化
■ファーマコフォア・モデリング機能を多方面から強化


詳細につきましては、PDF資料をご覧いただくか、またはお気軽にお問い合わせ下さい。

関連情報

BIOVIA Discovery Studio 2020
BIOVIA Discovery Studio 2020 製品画像
■Multi-Site Lambda Dynamics
■タンパク質製剤の物性予測
■露わな脂質二重層膜を含む分子動力学計算をサポート
■アンサンブル・ファーマコフォア・モデル
■タンパク質―低分子複合体構造を基にしたファーマコフォア・モデル
■抗体のヒト化をサポート
■共有結合ドッキングシミュレーション

この他、搭載されているデータベースが最新のエントリーを含むように更新されるなど、様々な機能強化がなされています。
『DISCOVERY STUDIO 2019』
『DISCOVERY STUDIO 2019』 製品画像
【新機能と強化された機能(抜粋)】
■New!分子動力学計算実行用にOpenMMインターフェースを通じたCHARMm GPUをサポート
■機能強化!シミュレーション・プロトコルでグリッドをサポート
■機能強化!多様なタンパク質のモデリングを強化
■New!新規プロトコル Analyze Crystal Contacts で結晶接触を生成、分析


※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
Discovery Studioを使用した抗体構造モデリング
Discovery Studioを使用した抗体構造モデリング 製品画像
【仕様】
BIOVIA Discovery Studioに含まれる抗体モデリング機能
■重鎖および軽鎖の多重配列アラインメントを同時にかつ独立に実施
■抗体のテンプレート構造を同定
■テンプレートをカノニカル構造でフィルター
■高い品質のホモロジー モデルを構築
■IMGT、Chotia、Honegger、Kabatといった、標準的なCDRループの定義を利用
■CDRループ構造の精密化をテンプレートを用いて、別のループ構造の移植によって、あるいは非経験的に実施
■連鎖構造の改良
■モデルの詳細な解析
■タンパク質のイオン化状態や残基のpKの予測
■予測されたpK値に基づき、与えられたpHに応じて残基をプロトン化
■pHの関数としてタンパク質の総電荷を算出
■等電点(pI)を予測
■温度あるいは pH 依存的な、変異による安定性変化の予測
■安定化のためのジスフィルド架橋箇所を特定
■ZDOCK を用いた抗体-抗原ドッキング
■重要な相互作用産機を特定
■CHARMm 37b2を使用してImplicit Solventモデルを用いた分子動力学(MD)シミュレーション、他

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