次世代シーケンサーのデータ解析をコマンド入力なしで実行!RNA-seqをはじめ様々なアプリケーションのデータ解析に対応!
『Partek Flow』は、様々なアプリケーションに対応した次世代シーケンサーデータ解析ソフトウェアです。
【対応アプリケーション】
■遺伝子発現解析(RNA-seq, Single Cell RNA-seq)
■miRNA発現解析(miRNA-seq)
■ゲノムリシーケンス解析(DNA-seq)
■転写因子結合部位解析(ChIP-seq)
■メチル化部位解析(MeDIP-seq)
■メタゲノム解析
【対応機器】
■イルミナ(HiSeq, NextSeq, MiSeq, MiniSeq)
■サーモフィッシャー(Ion S5, Ion Proton, Ion PGM)
『Partek Flow』は、ウェブブラウザーから操作するのでコマンド入力したりパラメーターを手入力する必要はありません。インストールしたサーバーに接続可能なネットワーク上のあらゆるマシンから利用できます。読み込んだデータの種類に対応した解析メニューを表示しますので、データ解析に慣れていないウェットの研究者でも簡単に操作できます。
※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
■優れたユーザーインターフェース
■充実したデータ解析機能
■多彩なデータ表示機能
■複数のユーザーが同時にどこからでも利用可能
【対応ファイル形式】
FASTQ / FASTA / SFF / CSFASTQ / CSFASTA / QUAL / SRA / BCF / VCF / BAM / SAM
【動作環境:サーバー】
■OS:Red Hat, CentOS, Fedora, Ubuntu (64bit)
Mac OS X 10.10以降
■CPU:2GHz以上、4コア以上 (STARを使用する場合は16コア以上を推奨)
■メモリ:32GB以上 (STARを使用する場合は38GB以上を推奨)
■ディスク:150MB以上の空き領域 (インストールのみ)
■その他(推奨):インターネット接続環境
【動作環境:サーバー】
■ウェブブラウザー:Google Chrome
■その他(推奨):インターネット接続環境1280×1024pixel以上のモニタ
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関連ダウンロード
NGSデータ解析ソフトウェア『Partek Flow』
上記では、電子ブックの一部をご紹介しております。
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株式会社モルシス