孤立系・分子凝集系など目的に応じた柔軟な分子構築が可能
MOEは、創薬・ライフサイエンス研究のための統合計算化学プラットフォームです。様々な分子モデルを簡単な操作で構築できます。
拡張ヒュッケル法を用いた力場パラメーターの自動作成により、低分子、タンパク質、核酸、合成ポリマー、そららの複合体に対して適切なパラメーターを割り当て、従来の分子の種類に応じた力場選択の迷いを排除することができます。
分子構造の前処理として、タンパク質の立体構造の確認と修正、水素原子付加状態の最適化などが可能です。
以下のような分子構築に対応しています。
■低分子
■ペプチド・タンパク質
■アミノ酸配列
■変異体構築
■DNA
■糖鎖
■合成ポリマー
■溶媒分子やカウンターイオンの配置
■バルクモデル（液滴、周期境界条件）
■スケッチャーツールからの分子のコピー＆ペーストに対応
以下のような分子シミュレーションが可能です。
■構造最適化計算
■配座解析
■分子動力学計算
■量子化学計算
■スペクトル予測(NMR, VCD)
■分子アラインメント
■3D-RISM法による溶媒解析
■ドッキングシミュレーション
MOEは、計算化学者やメディシナルケミスト、バイオロジストなどの様々なユーザーに利用されている分子モデリングソフトウェアです。
低分子、受容体構造、複合体構造などユーザーが持つ実験的な知見に基づき、柔軟かつ適切なアプローチでの分子設計が可能です。LBDD的なアプローチであればSAR解析やファーマコフォア解析、SBDD的なアプローチであればドッキングシミュレーションやフラグメント創薬など、目的にあわせた利用が可能です。
ユーザーフレンドリーなインターフェースを搭載し、初心者でも自由に操作ができます。MOEに搭載されていないアプリケーションは、新規追加も可能で、ユーザーに応じたメニュー編集も可能です。
NAMD, KINIME, Gaussian, GAMESS, MOPAC, Mogul, FlexX、Gold等のサードパーティ製品とMOEを連携させて利用できます。
医薬品開発では、低分子、中分子、抗体など様々な医薬品の設計にMOEは応用されています。
開発元のウェブページもあわせてご参照ください。
https://www.chemcomp.com/
低分子、受容体構造、複合体構造などユーザーが持つ実験的な知見に基づき、柔軟かつ適切なアプローチでの分子設計が可能です。LBDD的なアプローチであればSAR解析やファーマコフォア解析、SBDD的なアプローチであればドッキングシミュレーションやフラグメント創薬など、目的にあわせた利用が可能です。
ユーザーフレンドリーなインターフェースを搭載し、初心者でも自由に操作ができます。MOEに搭載されていないアプリケーションは、新規追加も可能で、ユーザーに応じたメニュー編集も可能です。
NAMD, KINIME, Gaussian, GAMESS, MOPAC, Mogul, FlexX、Gold等のサードパーティ製品とMOEを連携させて利用できます。
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