上記では、電子ブックの一部をご紹介しております。
次世代シーケンサーやマイクロアレイのデータ解析で得られた遺伝子リストにKEGGパスウェイ情報を使って生物学的解釈を追加
『Partek Pathway』は、Partek Genomics Suiteで次世代シーケンサーやマイクロアレイのデータを解析して得られた遺伝子リストにおいて有意に濃縮されているパスウェイを抽出できます。どのようなパスウェイが遺伝子リストにおいて有意に濃縮されているかを知ることで実験結果に生物学的解釈を得ることができます。
また、『Partek Pathway』は遺伝子の発現情報から全体が協調して発現変動しているパスウェイや一部の遺伝子だけが発現変動していて全体では有意差が得られないパスウェイを抽出できます。
【対応する解析メニュー】
■パスウェイエンリッチメント解析
■パスウェイANOVA
パスウェイコンテンツとしてKEGGデータベース(KEGG Pathway)を採用。（注）パスウェイをマップ表示する際に解析結果に基づいてp値やFold Changeの値で遺伝子を色分け表示します。
（注）Partek Inc.はKEGG Authorized Service Providerです。
※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
また、『Partek Pathway』は遺伝子の発現情報から全体が協調して発現変動しているパスウェイや一部の遺伝子だけが発現変動していて全体では有意差が得られないパスウェイを抽出できます。
【対応する解析メニュー】
■パスウェイエンリッチメント解析
■パスウェイANOVA
パスウェイコンテンツとしてKEGGデータベース(KEGG Pathway)を採用。（注）パスウェイをマップ表示する際に解析結果に基づいてp値やFold Changeの値で遺伝子を色分け表示します。
（注）Partek Inc.はKEGG Authorized Service Providerです。
※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
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株式会社モルシス
