上記では、電子ブックの一部をご紹介しております。
入力、抗体データベースに対するホモロジー検索、適切なキメラテンプレートの選択、モデル構造構築、構造最適化という一連のプロセスをシームレスに行うことができます。
相補性決定領域（CDR）を自動認識して配列アラインメントを行い、
それぞれの CDR について適切なテンプレートを自動的に選択します。
予測した抗体構造は、抗原との親和性、PPI解析、物性評価、エピトープマッピングなど様々な解析に利用できます。
【機能】
■抗体データベース
■領域別のアノテーション
■抗体のための相同配列検索
■抗体モデリング
■Fv、Fab、scFv、VHH、VLL、Ig 全長、二重特異性抗体、ヒト化抗体
■表面パッチ解析
■タンパク質ータンパク質ドッキング
■エピトープマッピング
■タンパク質の物性推算
■ループ/リンカーモデリング
■MOE/webアプリケーション
■モデリングの自動化
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関連情報
『MOE』抗体モデリング
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MOE抗体設計アプリケーション
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MOE 抗体アプリケーション例
★抗体モデリング
・領域(FR、CDR)ごとのテンプレート検索
・各タイプのモデリング
Fv, Fab, F(ab’), rIg, Ig, VHH, VLL, 二重特異性抗体(bispecific抗体)、
一本鎖抗体(scFv)、ADC(Antibody-drug conjugate)、ヒト化抗体
・ループモデリング/リンカーモデリング(scFv)
★抗体設計
・アラニンスキャン, システインスキャン, 変異体スキャン
・バーチャルファージディスプレイ
・非天然アミノ酸の導入
・リガンドとの親和性予測
・分子表面特性
★タンパク質間相互作用解析 (PPI解析)
・相互作用検出
・疎水性/電荷表面パッチ解析
・タンパク質-タンパク質ドッキング
・エピトープマッピング
★Developability の評価
・化学的修飾部位の検出
・pHや構造変化を考慮した物性推算
・熱安定性、溶解性、粘度
★その他
・溶媒解析
・分子シミュレーション、分子動力学計算
バイオ医薬品開発用カスタムアプリケーション『Bio-MOE』
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【抗体モデリングと解析機能】
■重鎖と軽鎖の配列からの抗体の自動モデリング
■各領域(Fv, Fab, F(ab)2, rIg, Ig)のモデリング
■単一ドメイン抗体(VHH, VLL)、一本鎖抗体(scFv)、ヒト化抗体、
バイスペシフィック抗体のモデリング
■抗原―抗体複合体モデリング
■抗体薬物複合体(ADC)や 糖鎖修飾の検討
■複数の配列を入力とした連続計算
■バックミューテーション解析
■配列と構造に基づいたLiabilityの検出
■溶媒和を考慮した相互作用エネルギー(GBVI)や
重鎖-軽鎖間の相互作用エネルギーによるモデル評価
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お問い合わせ
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株式会社モルシス
