上記では、電子ブックの一部をご紹介しております。
リガンドの結合様式の解析やバーチャルスクリーニングを行うBioSolveIT社製ツール
『FlexS』は、リガンド構造から予測されるファーマコフォアフィーチャーの
投影点をベースとして構造アラインメントを行い、妥当な重ね合わせ構造を
高速に求めるツールです。
また、高速なスクリーンモードを利用することで受容体構造を用いずに
化合物の3次元構造のみを使用したバーチャルスクリーニングに適用できます。
配置は、ファーマコフォアの投影点の一致(水素結合、イオン結合、疎水性相互作用)と
vdW体積のオーバーラップに基づいてスコア化して評価します。
【特長】
■リガンド分子対重ね合わせを平均2分/1アラインメント、早いものは数秒で行う
■分子のフレキシビリティの評価は環状構造の有無と合わせ、ねじれ角の評価を行う
■参照リガンドは剛体として評価
■オプションモジュール:FlexS-C
※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
投影点をベースとして構造アラインメントを行い、妥当な重ね合わせ構造を
高速に求めるツールです。
また、高速なスクリーンモードを利用することで受容体構造を用いずに
化合物の3次元構造のみを使用したバーチャルスクリーニングに適用できます。
配置は、ファーマコフォアの投影点の一致(水素結合、イオン結合、疎水性相互作用)と
vdW体積のオーバーラップに基づいてスコア化して評価します。
【特長】
■リガンド分子対重ね合わせを平均2分/1アラインメント、早いものは数秒で行う
■分子のフレキシビリティの評価は環状構造の有無と合わせ、ねじれ角の評価を行う
■参照リガンドは剛体として評価
■オプションモジュール:FlexS-C
※詳しくはPDF資料をご覧いただくか、お気軽にお問い合わせ下さい。
関連情報
分子高速アラインメントツール『FlexS』
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【対応プラットフォーム】
■Windows
■Linux x86 32bit / 64bit
■MacOS X
お問い合わせ
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株式会社モルシス